중동 지역 전반에 대한 체계적이고 종합적인 연구를 수행하기 위하여 2000년 3월에 설립되었다. 언어, 역사, 종교, 정치, 경제, 사회, 문화에 관한 학제 간 연구를 통하여 우리 사회가 요구하는 통합적인 중동 연구의 견실한 토대 마련을 목표로 하고 있다. 본 연구소는 2000년 한국연구재단의 인문한국(HK) 지원사업 해외지역 연구분야 연구소로 선정되어, 현재 “사회변동과 호모이슬라미쿠스·샤리아 연구와 중동학 토대 구축”이라는 주제로 연구를 수행하고 있다.